1945年12月20日，民建总会第一次常务理事会通过了成立重庆分会的决议。会议指派章乃器、杨卫玉、徐崇林、鄢公复、赵懿明、田钟灵、董幼娴、辛德培、温仲六等9人组成重庆分会筹备委员会，进行筹建工作。

1946年1月4日，筹备委员会举行会议，增补了20位筹委会委员。2月24日，重庆分会在重庆市白象街西南实业大厦正式成立。根据总会理、监事不兼任分会理、监事的原则，大会选举了分会的领导机构。重庆分会为民建组建最早的一个分会，有会员300余人。

分会第一次理事会议决定，分会会址暂定在迁川工厂大厦内，与总会一起办公。同时，决定以《自由导报》为重庆分会机关报。民建总会迁往上海后，重庆分会迁至大梁子青年会大厦办公。

重庆分会成立以后，积极开展政治活动，揭露官僚资本的罪恶，帮助工商界提高认识。

当国民党宣布民建为非法团体后，重庆分会的活动转入地下。在重庆解放前夕，分会在护厂护矿、策动伪警人员起义等方面做了有效的工作，为重庆解放作出了积极贡献。